Абу-Якуб Юсуф аль-Хамадани появился на свет в 1048 году на территории Хамадана. По достижению совершеннолетия, его отправили на учебу в Багдад, который прославили проповедники, ученые и суфисты. По истечению времени ему удалось добиться успехов и стать уважаемым проповедником, знающим хадисы, во всем Востоке и Центральной Азии. Далее Хамадани перестал заниматься преподавательской работой, переехал в Мерв, начав вести аскетический образ жизни. Здесь его очень почитали. Его советы ценились знатными людьми, шейхами и старейшинами.
Длительное время он проживал на территории Герата и хорасанского Бамийина. Последние годы жизни он провел в Мерве, где в 1140 году скончался. Ввиду посещения многочисленными паломниками его могилы, поблизости были построены в 13 столетии большая школа с мечетью, а над местом погребения появилась усыпальница. Постройка постепенно разрушалась в результате набегов и с течением времени.
Археологические раскопки в Мерве послужили причиной реконструкционных мероприятий на могиле Хамадани. Позднее мечеть-усыпальницу полностью восстановили. На близлежащей территории появились ряд строений. Одно из них является олицетворением склепа над мавзолеем именитого суфия, здесь находится черная мраморная плита из мрамора, которую декорировали с помощью надписей и орнаментов цветочных мотивов. Западный сектор ансамбля стал местом размещения ханаки, специального помещения для совершения молитвы, окаймленной высоким центральным айваном.
Ежегодно толпы зарубежных вояжеров, приобретая горящие туры в Туркменистан, обязательно посещают эту мечеть, так как во время проповедей Юсуфа Хамадани зачастую происходили чудеса.